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1、稅收計算方式不同，小規模納稅人的應納稅額=銷售額×征收率，一般納稅人的應納稅額=當期銷項稅額－當期進項稅額；
2、稅率的不同：一般納稅人適用的稅率主要有17%、13%、11%、6%等幾檔，而小規模納稅人現在一律適用3%的征收率；
3、發票使用不同：一般納稅人銷售貨物可以開具增值稅專用發票，購進貨物可以取得增值稅專用發票，而小規模納稅人銷售貨物的時候不能開具增值稅專用發票；
4、賬務處理的不同：一般納稅人按價款部分計入成本，稅款部分計入“應交稅金—應交增值稅—進項稅額”賬戶，而小規模納稅人按全額進入成本。
（一）首先是規模上的標準：
從事生產貨物或提供應稅勞務，或以其為主兼營貨物批發或零售的納稅人(適用50%的標準)，年應稅銷售額大于50萬元為一般納稅人；
從事貨物批發或零售的納稅人，年應稅銷售額大于80萬元為一般納稅人；
應稅服務年銷售額標準為500萬元(不含稅銷售額)，大于500萬元為一般納稅人；
應稅服務年銷售額，是指納稅人在連續不超過12個月的經營期內，提供交通運輸和現代服務累計應征增值稅銷售額，含免稅、減稅銷售額。
（二）其次是納稅人性質和會計核算程度方面的標準：
年應稅銷售額超過小規模納稅人標準的其他個人(自然人)按小規模納稅人納稅;非企業性單位和不經常發生應稅行為的企業可自行選擇是否按小規模納稅人納稅。
年應稅銷售額未超過標準以及新開業的納稅人，有固定的經營場所，會計核算健全，能準確提供銷項稅額、進項稅額的可認定為一般納稅人。
《中華人民共和國增值稅暫行條例》第二條 增值稅稅率： （一）納稅人銷售貨物、勞務、有形動產租賃服務或者進口貨物，除本條第二項、第四項、第五項另有規定外，稅率為17%。
《中華人民共和國增值稅暫行條例》第四條 除本條例第十一條規定外，納稅人銷售貨物、勞務、服務、無形資產、不動產（以下統稱應稅銷售行為），應納稅額為當期銷項稅額抵扣當期進項稅額后的余額。應納稅額計算公式： 應納稅額=當期銷項稅額－當期進項稅額
《中華人民共和國增值稅暫行條例》第十一條 小規模納稅人發生應稅銷售行為，實行按照銷售額和征收率計算應納稅額的簡易辦法，并不得抵扣進項稅額。應納稅額計算公式： 應納稅額=銷售額×征收率 小規模納稅人的標準由國務院財政、稅務主管部門規定。
《中華人民共和國增值稅暫行條例》第十二條 小規模納稅人增值稅征收率為3%，國務院另有規定的除外。
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